A nagy tudományegyetemek is vesztesei lehetnek a bolognai folyamatnak, miután jelen állás szerint több bejáratott szakon sem indulhat 2009-ben mesterképzés Szegeden, Debrecenben, avagy Pécsett. Az egyetemek szeptemberben újra próbálkoznak, ám az idő fogy. Debrecenben többek között az olasz- és franciatanári diplomára vágyók járnak rosszul. Manherz Károly szerint már jelen állás szerint is elég mesterszak van, így nem kell félni attól, hogy az államilag támogatott 21700 hallgató nem talál majd magának megfelelő helyet jövőre.